Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTRRQ9UBK8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms