Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP28Q9P2N2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms