Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTTNBP2NLQ9P2B4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms