Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXL2Q9NZ53 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PODXL2Q9NZ53 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms