Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GGA3Q9NZ52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGA3Q9NZ52 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms