Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VNN3Q9NY84 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VNN3Q9NY84 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms