Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BARHL2Q9NY43 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms