Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT4Q9NX09 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms