Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM140Q9NV12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM140Q9NV12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms