Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms