Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PKDREJQ9NTG1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PKDREJQ9NTG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms