Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CISHQ9NSE2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CISHQ9NSE2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms