Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER3Q9NSC5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms