Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms