Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HELLSQ9NRZ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HELLSQ9NRZ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms