Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM1Q9NRU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNNM1Q9NRU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms