Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DUOX2Q9NRD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DUOX2Q9NRD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms