Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRIP3Q9NQ35 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms