Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO1B3Q9NPD5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms