Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB18Q9NP72 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB18Q9NP72 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms