Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC17Q9NP64 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC17Q9NP64 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms