Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB6Q9NP58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB6Q9NP58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms