Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CENPJQ9HC77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms