Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3GQ9HC16 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3GQ9HC16 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms