Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF408Q9H9D4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF408Q9H9D4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms