Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf33Q9H7E9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf33Q9H7E9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C8orf33Q9H7E9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf33Q9H7E9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf33Q9H7E9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms