Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP3Q9H6T3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAP3Q9H6T3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms