Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MFSD1Q9H3U5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD1Q9H3U5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms