Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP2Q9H175 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRNP2Q9H175 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSRNP2Q9H175 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSRNP2Q9H175 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP2Q9H175 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP2Q9H175 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRNP2Q9H175 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms