Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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HOXD1Q9GZZ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD1Q9GZZ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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