Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIF3L1Q9GZT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NIF3L1Q9GZT8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms