Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms