Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MTMR12Q9C0I1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTMR12Q9C0I1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms