Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms