Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms