Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NLRP1Q9C000 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NLRP1Q9C000 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms