Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCO2Q9BYV7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCO2Q9BYV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms