Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC4A5Q9BY07 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms