Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNG6Q9BXT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms