Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLVAPQ9BX97 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms