Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTKNQ9BST9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTKNQ9BST9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms