Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM29Q9BSF4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms