Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM79Q9BSE2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM79Q9BSE2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms