Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SIKE1Q9BRV8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms