Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBA1CQ9BQE3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms