Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECSITQ9BQ95 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECSITQ9BQ95 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms