Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPOCK3Q9BQ16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPOCK3Q9BQ16 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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