Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDRT15Q96T59 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDRT15Q96T59 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDRT15Q96T59 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDRT15Q96T59 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDRT15Q96T59 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDRT15Q96T59 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDRT15Q96T59 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms