Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UIMC1Q96RL1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms