Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HHIPQ96QV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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